MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 56940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015387	TCGCCC	2	12	156125	156136	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	328949693
4002	NC_015387	CGA	2	6	156159	156164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949693
4003	NC_015387	CGC	2	6	156174	156179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949693
4004	NC_015387	CGG	2	6	156204	156209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949693
4005	NC_015387	CCT	2	6	156225	156230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949693
4006	NC_015387	GGA	2	6	156267	156272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949693
4007	NC_015387	TCC	2	6	156308	156313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949693
4008	NC_015387	CG	3	6	156341	156346	0 %	0 %	50 %	50 %	328949693
4009	NC_015387	CGC	2	6	156450	156455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949693
4010	NC_015387	GCTC	2	8	156477	156484	0 %	25 %	25 %	50 %	328949693
4011	NC_015387	GGA	2	6	156543	156548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949693
4012	NC_015387	CGG	2	6	156551	156556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949693
4013	NC_015387	CG	3	6	156580	156585	0 %	0 %	50 %	50 %	328949693
4014	NC_015387	CCCGAT	2	12	156664	156675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	328949693
4015	NC_015387	GC	3	6	156684	156689	0 %	0 %	50 %	50 %	328949693
4016	NC_015387	GCCCCG	2	12	156738	156749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949693
4017	NC_015387	GAG	2	6	156781	156786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949693
4018	NC_015387	GCC	2	6	156853	156858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949693
4019	NC_015387	GCC	2	6	156874	156879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949693
4020	NC_015387	GAG	2	6	156898	156903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949693
4021	NC_015387	CAG	2	6	157008	157013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_015387	CG	4	8	157067	157074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_015387	TGG	2	6	157079	157084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015387	CGG	2	6	157099	157104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015387	AGG	2	6	157201	157206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015387	ATG	2	6	157211	157216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949694
4027	NC_015387	AAGG	2	8	157442	157449	50 %	0 %	50 %	0 %	328949694
4028	NC_015387	ACC	2	6	157458	157463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949694
4029	NC_015387	CCA	2	6	157587	157592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949694
4030	NC_015387	CGCC	2	8	157631	157638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4031	NC_015387	AGG	2	6	157645	157650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015387	CCG	2	6	157694	157699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949695
4033	NC_015387	CG	3	6	157698	157703	0 %	0 %	50 %	50 %	328949695
4034	NC_015387	GGA	3	9	157772	157780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949695
4035	NC_015387	TGG	3	9	157858	157866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949695
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4037	NC_015387	CGG	2	6	157896	157901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949695
4038	NC_015387	TCCCCC	2	12	157939	157950	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	328949695
4039	NC_015387	GGA	2	6	158048	158053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949695
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4041	NC_015387	TGC	2	6	158110	158115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949696
4042	NC_015387	GTC	3	9	158166	158174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949696
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4044	NC_015387	GCG	2	6	158189	158194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949696
4045	NC_015387	AGG	2	6	158221	158226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949696
4046	NC_015387	CGA	2	6	158252	158257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949696
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4048	NC_015387	CGGC	2	8	158368	158375	0 %	0 %	50 %	50 %	328949696
4049	NC_015387	GC	3	6	158374	158379	0 %	0 %	50 %	50 %	328949696
4050	NC_015387	TG	3	6	158382	158387	0 %	50 %	50 %	0 %	328949696
4051	NC_015387	GC	3	6	158425	158430	0 %	0 %	50 %	50 %	328949696
4052	NC_015387	TGC	2	6	158443	158448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949696
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4054	NC_015387	CCAT	2	8	158571	158578	25 %	25 %	0 %	50 %	328949697
4055	NC_015387	GCC	2	6	158610	158615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949697
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4057	NC_015387	C	6	6	158657	158662	0 %	0 %	0 %	100 %	328949697
4058	NC_015387	CCT	2	6	158675	158680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949697
4059	NC_015387	GC	3	6	158698	158703	0 %	0 %	50 %	50 %	328949697
4060	NC_015387	CTC	4	12	158748	158759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949697
4061	NC_015387	TCGG	2	8	158763	158770	0 %	25 %	50 %	25 %	328949697
4062	NC_015387	CG	4	8	158818	158825	0 %	0 %	50 %	50 %	328949697
4063	NC_015387	CGC	2	6	158894	158899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949697
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4067	NC_015387	TCA	2	6	158953	158958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949697
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4071	NC_015387	G	6	6	159085	159090	0 %	0 %	100 %	0 %	328949697
4072	NC_015387	GGC	2	6	159136	159141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949697
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4080	NC_015387	GCCGC	2	10	159463	159472	0 %	0 %	40 %	60 %	328949697
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4091	NC_015387	GGGGT	2	10	159971	159980	0 %	20 %	80 %	0 %	328949698
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4106	NC_015387	GAG	2	6	160671	160676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949699
4107	NC_015387	CGC	2	6	160679	160684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949699
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4110	NC_015387	GC	4	8	160737	160744	0 %	0 %	50 %	50 %	328949699
4111	NC_015387	GCCG	2	8	160772	160779	0 %	0 %	50 %	50 %	328949699
4112	NC_015387	GGCC	2	8	160821	160828	0 %	0 %	50 %	50 %	328949699
4113	NC_015387	CAG	2	6	160854	160859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949699
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4119	NC_015387	CGC	2	6	161098	161103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949700
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4123	NC_015387	GC	4	8	161246	161253	0 %	0 %	50 %	50 %	328949700
4124	NC_015387	GCC	2	6	161258	161263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949700
4125	NC_015387	CG	4	8	161280	161287	0 %	0 %	50 %	50 %	328949700
4126	NC_015387	GC	3	6	161293	161298	0 %	0 %	50 %	50 %	328949700
4127	NC_015387	GC	3	6	161326	161331	0 %	0 %	50 %	50 %	328949700
4128	NC_015387	CCG	2	6	161358	161363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949700
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4132	NC_015387	CCG	2	6	161483	161488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949700
4133	NC_015387	CG	4	8	161527	161534	0 %	0 %	50 %	50 %	328949700
4134	NC_015387	CAC	2	6	161554	161559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949700
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4138	NC_015387	CCT	2	6	161780	161785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_015387	ACC	2	6	161794	161799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949701
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4143	NC_015387	CG	3	6	161913	161918	0 %	0 %	50 %	50 %	328949701
4144	NC_015387	CGC	2	6	161943	161948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949701
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4147	NC_015387	CCT	2	6	162056	162061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949701
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4150	NC_015387	CGT	2	6	162201	162206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949701
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4157	NC_015387	CCCCG	2	10	162533	162542	0 %	0 %	20 %	80 %	328949701
4158	NC_015387	CGCGGC	2	12	162543	162554	0 %	0 %	50 %	50 %	328949701
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4160	NC_015387	CG	4	8	162588	162595	0 %	0 %	50 %	50 %	328949701
4161	NC_015387	CG	3	6	162597	162602	0 %	0 %	50 %	50 %	328949701
4162	NC_015387	CAG	2	6	162666	162671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949701
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4167	NC_015387	GCGCG	2	10	162944	162953	0 %	0 %	60 %	40 %	328949701
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4198	NC_015387	CGT	2	6	164074	164079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949702
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4214	NC_015387	AGGA	2	8	164667	164674	50 %	0 %	50 %	0 %	328949702
4215	NC_015387	CCCG	2	8	164701	164708	0 %	0 %	25 %	75 %	328949703
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4222	NC_015387	CG	3	6	164955	164960	0 %	0 %	50 %	50 %	328949703
4223	NC_015387	AGG	2	6	164961	164966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949703
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4225	NC_015387	GAG	3	9	164996	165004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949703
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4228	NC_015387	CTC	2	6	165136	165141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949704
4229	NC_015387	TGGAC	2	10	165156	165165	20 %	20 %	40 %	20 %	328949704
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4231	NC_015387	CCT	2	6	165297	165302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949704
4232	NC_015387	GCG	2	6	165315	165320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949704
4233	NC_015387	CG	3	6	165366	165371	0 %	0 %	50 %	50 %	328949704
4234	NC_015387	ACC	2	6	165455	165460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949704
4235	NC_015387	GCC	2	6	165493	165498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949704
4236	NC_015387	CAG	2	6	165499	165504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949704
4237	NC_015387	ATC	2	6	165509	165514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949704
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4239	NC_015387	CG	3	6	165578	165583	0 %	0 %	50 %	50 %	328949704
4240	NC_015387	AGC	2	6	165671	165676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949704
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4242	NC_015387	GC	3	6	165738	165743	0 %	0 %	50 %	50 %	328949704
4243	NC_015387	CGT	2	6	165756	165761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949704
4244	NC_015387	GTG	2	6	165800	165805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949704
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4497	NC_015387	GGC	2	6	176144	176149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949710
4498	NC_015387	AGG	2	6	176168	176173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949710
4499	NC_015387	GCG	2	6	176211	176216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949710
4500	NC_015387	AGG	2	6	176231	176236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949710

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